关于小分子RNAs的沉默机制已经得到了多方面的认可，由此也荣获了2006年的诺贝尔奖，这种针对基因调控和基因组防御方面的作用机制，令小分子RNA生物合成序列选择多种多样，也预示着多种新机制。在一项新研究中，研究人员发现了一种称为停滞剪接（stalled spliceosomes，生物通译）的作用机制，能作为小分子RNA生物合成的一种诱导起始物，从而用于基因沉默和生物防御。
这项研究公布在Cell杂志上，来自美国西北大学的Karen S. Kim Guisbert和Erik J. Sontheimer特以“Quit Stalling or Youll Be Silenced”为题，介绍了这项成果，他们指出这种能被RNA沉默机器识别的信号，表明了剪接具有生物防御的功能。
选择性剪接（也叫可变剪接）是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点组合）产生不同的mRNA剪接异构体的过程，而zui终的蛋白产物会表现出不同或者是相互拮抗的功能和结构特性，或者，在相同的细胞中由于表达水平的不同而导致不同的表型。
剪接与基因沉默关系密切，今年1月，一组研究人员就通过分析比较了86个不同真核基因组序列，分析了小RNA辅助因子的系统发生谱，并指出，在RNA剪接和小RNA介导的基因沉默之间存在密切关联（1月31日Nature）。
在这篇文章中，研究人员以一种致病真菌：新型隐球菌为研究对象，发现当细胞剪接机器遇到转座子这样的内含子时，就会停滞，而一种称为剪接体耦合核RNA干扰（Spliceosome-Coupled And Nuclear RNAi，SCANR，生物通译）复合物的作用机制，能识别这一故障，启动合成相应的小分子RNA，用来中和转座子的RNA，这样就能有助于识别外源基因并加以抵御。
转座子是一类广泛存在，能够在基因组中通过转录或逆转录，在内切酶的作用下，在其他基因座上出现的DNA序列，研究表明，转座子异常跳跃，如插入到重要基因中，就会使基因功能出现故障，引发疾病或出生缺陷。而SCANR作用机制能像免疫系统一样，区分自我和非我的序列，识别外源的入侵者，防止由于转座子异常跳跃引发的疾病。
这项研究表明，mRNA前体在剪接体上的停滞作用，是siRNA积累过程的必需元件，而SCANR复合物对mRNA前体的识别，能与沉默产生动力学竞争，从而促进siRNA生成。
